A diplomáciai kapcsolatok felvételére 1970. december 12-én került sor, azóta hazánkat Máltán római székhelyű nagykövetünk képviseli. A két ország hosszú idő óta tiszteletbeli konzuli képviseletet tart fent egymás területén: Michael Soler 1991 óta hazánk vallettai tiszteletbeli konzulja. Dr. Paczolay Péter 2015. szeptember 17-én adta át megbízólevelét Vallettában Marie Louise Coleiro Preca köztársasági elnöknek. A máltai nagykövet, Giovanni Miceli 2014 októberében adta át megbízólevélét Áder János köztársasági elnök részére. A nagykövet kizárólag Magyarországra akkreditált, székhelye Vallettán van.
Kétoldalú miniszterelnöki találkozóra Vallettában 2010. november 21-22-én került sor: Orbán Viktor kormányfő Lawrence Gonzival elsősorban a magyar EU-elnökség programjáról egyeztetett. Ezt megelőzően magyar miniszterelnök még nem járt hivatalos látogatáson Máltán. Orbán Viktor miniszterelnök ugyancsak részt vett 2015. november 11-12. között a Máltán megrendezésre került migrációs csúcson. Joseph Muscat máltai miniszterelnök 2016. december 1-jén látogatott Budapestre, ahol kétoldalú megbeszéléseket folytatott Orbán Viktor miniszterelnökkel a máltai EU-elnökséget érintő témákról.
A magyar-máltai gazdasági kapcsolatok a két ország méretkülönbsége és a földrajzi távolság következtében viszonylag szerények, azonban növekvő tendenciát mutatnak. A gazdasági kapcsolatok dinamizálásának alapot teremthet az egyre jelentősebb létszámú magyar diaszpóra megjelenése Máltán. Máltai adatok szerint mintegy 1.600 magyar él a 450 ezres lakosú szigetországban, bár nem hivatalos becslések szerint a magyarok száma ennek akár duplája is lehet.
Az MNB adatai alapján 2014-ben máltai vállalatok 312,7 millió euró közvetlen tőkebefektetéssel rendelkeztek Magyarországon, míg magyar vállalatok 105 millió eurónyi közvetlen tőkefektetéssel rendelkeznek Máltán. A KSH adatai alapján 2013-ban 43 máltai vállalat 614 főt foglalkoztatott Magyarországon.
